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編輯推薦: |
相对于生物学,化学,地质学等,海洋科学专业开办时间较短,积累教材较少。古菌是微生物的重要组成部分,本书在充分吸纳部分海洋微生物学实验课的同时,在实验材料和内容安排上充分体现了古菌特色,增加了学生学习过程的新鲜感。
市场暂无围绕古菌实验设计的相关性教材,本书的实验充分体现了海洋微生物学与其他学科之间的交叉,对有志于从事海洋微生物学,特别是古菌相关研究的学生,能够起到入门指导作用。
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內容簡介: |
古菌,是海洋微生物的重要组成部分,虽然和细菌、真核生物一起构成了生物的三域系统,但对于大多数人来说还是非常陌生。《古菌海洋学实验》第一部分,是利用嗜盐古菌作为主要材料,设计一些相对简单的实验内容,让学生掌握古菌实验的基本技术:无菌操作技术,微生物分类培养技术,古菌生长曲线测定,海洋样品的采集和DNA提取等。第二部是综合性实验,内容包括海水和沉积物海洋古菌的定量—荧光显微镜计数法(吖啶橙、Subgreen、DAPI等),流式检测法,荧光定量PCR,荧光原位杂交实验(FISH)等,特别注重分子生物学的结合。第三部分是设计下和研究性的实验内容,这部分特别注重先进性和可操作性,包括海洋古菌、热泉古菌、和嗜盐古菌的富集培养等。
《古菌海洋学实验》适用于高校海洋科学、生命科学等专业,可供海洋微生物学实验、海洋分子生物学实验、海上实习、极端环境生命过程野外实习等课程使用。
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關於作者: |
郭静
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郭静,南方科技大学实验师,2017年加入南科大海洋系后一直从事实验教学工作。作为第一作者发表教学科研论文10余篇,参与了已获批省级示范教学中心的《前沿海洋技术三维一体环境监测实验教学示范中心》和海洋微生物学教研室的申请与建设工作。作为指导老师,指导数十名本科生获批攀登计划或者大创计划。
张传伦
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张传伦,南方科技大学海洋与工程系讲席教授和国家特聘教授(2012至今)。1994年获得美国德州农工大(TAMU)博士学位,1994—1998年在美国橡树岭国家实验室从事博士后研究工作;1998年起历任美国密苏里大学副教授,美国佐治亚大学海洋系副教授,终身教授;2008—2016年兼任同济大学海洋学院讲座教授,20171月起任职南科大并兼任教学系副主任,2019创立了“深圳海洋地球古菌组学重点实验室”,致力于古菌生态、地球化学及生命演化的研究和人才培养。主要研究方向为微生物(特别是古菌)在环境及能源、地质历史演化及全球变化中的作用。在国际地球科学和生命科学期刊上发表学术论文300余篇,Google Scholar引用高达112132次,H-index为64。目前担任欧洲《微生物前沿-古菌生物学(Frontiers in Microbiology-Biology of Archaea)》期刊主编, 《古菌(Archaea)》和《中国科学:地球科学》期刊编委。
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目錄:
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基础性实验
实验一 古菌培养基的配制与灭菌
实验二 古菌的分离、接种和培养
实验三 利用分光光度法测定古菌的生长曲线
实验四 海洋沉积物微生物平板菌落计数法
实验五 海水样品的收集及滤膜 DNA 提取
实验六 PCR 扩增和琼脂糖凝胶电泳
实验七 古菌菌种的保存与复苏
综合性实验
实验八 海洋古菌的定量———荧光定量 PCR 法
实验九 海水细菌荧光显微计数
实验十 荧光原位杂交技术定量氨氧化古菌
实验十一 海洋病毒荧光显微计数
实验十二 拉曼光谱在古菌研究中的应用
实验十三 采用冷冻电子断层扫描解析细菌和古菌的细胞形貌结构
实验十四 沉积物中古菌脂类提取与鉴定
设计性实验
实验十五 古菌在海洋中的分布: 夏季珠江口冲淡水对MGⅡ的空间演替分布规律的影响
实验十六 热泉古菌的分离、培养和多样性研究
实验 16.1 热泉古菌的培养基的制备
实验 16.2 热泉古菌的采集
实验 16.3 热泉水环境参数的测定
实验 16.4 热泉微生物富集培养与显微镜观察
实验 16.5 热泉古菌的保藏
实验 16.6 高温微生物蛋白稳定性的探究
实验 16.7 热泉古菌多样性研究
实验 16.8 热泉古菌 16S rDNA 基因片段克隆文库的构建
实验 16.9 热泉古菌多样性分析
实验十七 青海湖嗜盐古菌多样性、胞外酶活性及拮抗作用探究
实验 17.1 青海湖环境样品嗜盐古菌培养基的配制与分离培养优化
实验 17.2 嗜盐古菌基于 16S rRNA 基因的初步分子鉴定
实验 17.3 嗜盐古菌菌株的胞外酶活性检测
实验17.4 嗜盐古菌菌株的抑菌活性检测与拮抗活性物质理化性质测定
实验十八 海洋古菌 MGⅠ及 MGⅡ的培养
附录 MGⅠ培养基配方
实验十九 菌藻互作实验(MGⅡ与聚球藻生态关系研究)
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