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內容簡介: |
《猪重要性状的组学遗传基础与改良》围绕猪遗传育种研究,主要包括概述、猪基因组遗传评估与基因挖掘、猪功能基因组研究进展、猪重要性状的遗传基础和猪遗传改良的研究进展与展望五大部分。其主旨是,集中展示我国学者在猪重要性状遗传基础研究方面的成果,同时系统总结国内外猪多组学研究的最新进展。
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目錄:
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目录第一篇 概述第一章家猪起源和重要性状的遗传改良 3第一节家猪 3第二节性状及其分类 7参考文献 11第二章猪组学数据的解析与应用 13第一节组学数据的范畴 13第二节组学数据分析的基本方法 17第三节组学数据分析的新技术 22第四节猪重要经济性状组学分析案例 26参考文献 30第二篇 猪基因组遗传评估与基因挖掘第三章基因组选择育种统计模型研究进展 35第一节基因组选择概念的提出 35第二节最佳线性无偏预测法估计育种值 36第三节个体亲缘关系矩阵的构建 37第四节方差组分估计 40第五节基因组选择GBLUP的改进模型 42第六节基因组选择软件HIBLUP的安装及使用 44参考文献 50第四章基因组选择育种模型的评估及影响因素 52第一节基因组选择育种模型的评估 52第二节基因组选择育种模型的影响因素 58参考文献 63第五章猪高效基因组育种技术的创制与应用 65第一节生产性能测定和样品采集 65第二节核酸提取和基因分型 72第三节估计基因组育种值和计算选择指数 73参考文献 75第六章全基因组关联分析统计模型的研究进展 77第一节全基因组关联分析的简介 77第二节全基因组关联分析中的数据 78第三节全基因组关联分析的流程和模型发展 82第四节全基因组关联分析软件rMVP的安装使用 84参考文献 98第七章猪基因组育种模拟及规划 100第一节育种模拟及规划的进展 100第二节育种模拟及规划的原理 102第三节育种模拟及规划软件SIMER的安装使用 110参考文献 129第八章猪整合组学基因评分推荐体系构建 131第一节猪多组学整合现状 131第二节猪整合组学基因评分推荐体系的设计与构建 133第三节猪整合组学知识库ISwine的使用 143参考文献 151第三篇 猪功能基因组研究进展第九章猪的调控元件和三维基因组学研究进展 155第一节DNA调控元件 155第二节多层次的基因组 158第三节猪基因组功能调控元件注释与三维基因组学研究 163参考文献 164第十章猪表观基因组学研究进展 168第一节表观遗传学相关概念、基本特征及研究内容 168第二节表观遗传产生的分子遗传机制 174第三节猪重要性状表观遗传机制的研究进展 180参考文献 191第十一章猪转录组学研究进展 196第一节猪mRNA-seq研究进展 196第二节猪miRNA组学研究进展 200第三节猪lncRNA组学研究进展 203第四节猪circRNA组学研究进展 207第五节猪全转录分析研究进展 209参考文献 211第十二章猪蛋白质组学研究进展 216第一节猪蛋白质组学的概述 216第二节蛋白质组学在猪相关疾病中的研究进展 218第三节蛋白质组学在猪营养调控中的研究进展 220第四节蛋白质组学在猪生长发育中的研究进展 221第五节蛋白质组学在猪肉品质中的研究进展 221第六节蛋白质组学与猪繁殖性状 222第七节蛋白质组学在猪疾病模型中的研究进展 224第八节蛋白质组学技术在猪中的应用展望 225参考文献 226第十三章猪胚胎工程与基因修饰育种新技术 229第一节胚胎工程育种技术 229第二节转基因育种与转基因克隆动物技术 233第三节干细胞育种 241参考文献 244第四篇 猪重要性状的遗传基础第十四章猪生长速度与饲料效率的遗传改良 251第一节猪生长速度与饲料效率的度量及其遗传特性 251第二节猪生长速度与饲料效率的遗传基础研究 254第三节猪生长性状的遗传改良 256参考文献 261第十五章猪胴体性状的遗传基础及改良 265第一节猪胴体性状的遗传特性 265第二节猪胴体性状的遗传基础研究 268第三节猪肌肉生长速度与胴体组成性状的遗传改良 270第四节猪背膘厚、眼肌面积与瘦肉率的遗传改良 273第五节上市肉猪的胴体评估与分级及其在推动生猪改良中的意义 277参考文献 278第十六章猪繁殖性状的遗传基础及改良 282第一节猪繁殖性状的基本特征 282第二节公猪繁殖性状的遗传基础研究 284第三节母猪繁殖性状的遗传基础研究 290第四节猪繁殖性状的遗传改良 293参考文献 297第十七章猪的遗传缺陷与改良 302第一节猪遗传缺陷的定义 302第二节猪主要遗传缺陷及其危害 303第三节猪遗传缺陷的遗传方式 312第四节猪遗传缺陷相关候选基因的鉴定 315参考文献 320第十八章猪抗病抗逆与免疫性状的遗传基础与改良 327第一节猪抗病力的概念与度量 327第二节免疫性状 335第三节猪主要组织相容性复合体 339第四节猪抗病抗逆与免疫性状的遗传改良 342参考文献 356第十九章猪肉质性状的遗传基础及改良 360第一节猪肉质的组分性状及其度量 360第二节猪应激综合征与异常肉质 366第三节猪肉质性状的遗传基础研究 371第四节猪肉质性状的遗传改良 377参考文献 381第二十章猪的行为性状及其遗传 384第一节猪的行为性状 384第二节行为遗传学 392第三节猪遗传改良中行为性状及异常行为的改良 407参考文献 408第五篇 猪遗传改良的研究进展与展望第二十一章猪基因组组装研究进展 417第一节猪基因组计划研究进展与组织 417第二节猪基因组作图 419第三节猪基因组序列注释新进展 426参考文献 429第二十二章基因组选择在猪杂交生产中的应用 432第一节杂交猪的基因型填充技术 432第二节最大化纯种猪的杂交效果表现 436第三节非加性遗传效应在杂种生产中的应用 444参考文献 447第二十三章选择信号检测方法及其统计学问题 452第一节人工选择作用下的基因组印记 452第二节选择信号的类别 453第三节选择信号检验统计量 454第四节选择信号的基因组数据模拟软件与统计检验 459第五节畜禽基因组选择信号的可靠性验证 461第六节畜禽选择信号检测的影响因素与统计学问题 463第七节机器学习在选择信号上的应用 464第八节展望 465参考文献 466第二十四章基因组编辑技术在猪育种中的研究进展 470第一节基因编辑技术 470第二节CRISPR/Cas9技术应用与编辑效率评估 473第三节基于CRISPR系统的功能基因组学研究 478第四节基因组编辑分子育种技术 485参考文献 489第二十五章猪作为医学动物模型的研究进展 495第一节用于人类医学研究的小型猪品种及特点 496第二节猪作为人类神经系统疾病模型的研究进展 500第三节猪作为人类心血管疾病模型的研究进展 502第四节猪作为人类 2型糖尿病模型的研究进展 504第五节猪作为人类其他疾病模型的研究进展 511参考文献 515第二十六章猪种质特色基因发掘与中国地方猪种资源保护利用 519第一节猪种质特色基因的发掘 519第二节我国地方猪种资源概况 522第三节中国地方猪遗传资源的开发利用现状 526参考文献 530第二十七章猪的福利与育种 534第一节动物福利的概念与猪福利涵盖的内容 534第二节对动物福利的科学评价 535第三节国外关于动物福利的立法与标准 540第四节福利与动物健康和性能表现 542第五节猪的福利与育种目标、选种措施 545参考文献 546
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