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| 編輯推薦： |
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《功能蛋白质组学：技术与方法》每章都由相应领域的一线专家撰写，旨在帮助读者在生物学研究中开辟新的学术前沿，发现重要的药物靶点，开发通过临床验证的生物标志物和疾病诊断产品。
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| 內容簡介： |
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《功能蛋白质组学：技术与方法》阐述了在蛋白质组学领域研究蛋白质功能的技术和方法。内容涵盖从蛋白质的功能分析到蛋白质其它方面的分析，特别是翻译后修饰方面的研究。每章内容包括各领域背景知识，进行这些研究所需的材料和试剂，实验技术的具体步骤，实验中可能出现的问题分析和排除以及易错步骤的重点提示。《功能蛋白质组学：技术与方法》每章都由相应领域的一线专家撰写，旨在帮助读者在生物学研究中开辟新的学术前沿，发现重要的药物靶点，开发通过临床验证的生物标志物和疾病诊断产品。《功能蛋白质组学：技术与方法》可供生命科学、基础医学和药学等领域研究生和其他研究人员参阅。
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| 關於作者： |
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王星，本书主编。1983年毕业于山东大学微生物学专业，1988年获得中国科学院上海植物生理研究所微生物学博士。1989年在美国俄亥俄州立大学生命科学学院做博士后研究，其后任俄亥俄州立大学生物工程中心和医学院科学家。1997-2011年在辉瑞制药工作，历任资深科学家、首席科学家、副院士兼实验室主任，2006年获得辉瑞研发成就奖。迄今发表论文三十多篇，获得国际专利多项，受邀在多种国际会议发言（AACR，ACS，WCBP，IBC，CHI 等），Biotech Bioeng等多种期刊评审科学家。2011年在美国创建Array Bridge生物技术公司，任CEO至今。马悦欣，本书译者，大连海洋大学教授。承担本科生《微生物学》和研究生《微生物生态学》教学工作。主持和参加欧盟第五框架计划、国家高技术发展研究计划（863计划）、国家科技支撑计划、国家自然科学基金等30余项科研项目。获中华农业科技二等奖1项，辽宁省技术发明三等奖1项等。在国内外核心学术刊物上共发表论文近80篇，其中SCI收录20余篇。
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| 目錄：
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第1章 为什么要发展功能蛋白质组学 001
第2章 检测SERPIN蛋白酶抑制剂功能亚组的方法 027
第3章 线粒体膜蛋白的双向16-BAC/SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 037
第4章 采用PEP技术系统分析人血清中糖酵解酶的活性 047
第5章 蛇毒蛋白质组学中的蛋白质分析策略 057
第6章 提高植物蛋白质组覆盖率的分离技术：蛋白质和肽的平行分离和综合分析 065
第7章 高密度蛋白质芯片用于生物标志物筛选的系统分析流程 075
第8章 肠道微生物群落的宏蛋白质组学研究 087
第9章 双单向电泳在免疫蛋白质组学中的应用 095
第10章 BioID：一种邻近依赖标记方法在蛋白质组学中的应用 102
第11章 蛇毒蛋白质组学在体内抗蛇毒血清评估中的功能应用 109
第12章 在微生物分泌蛋白组中糖活性酶的蛋白质组检测 114
第13章 质谱在功能蛋白质组学中的应用 128
第14章 用功能蛋白质组学分析不同信号转导途径之间的关联 142
第15章 基于质谱的蛋白质组学鉴定蛋白质的非预期性修饰 163
第16章 用无标记LC-MS/MS方法分析通过激光定位拨离技术分离的郎格罕氏岛的蛋白质组 181
第17章 靶向蛋白质组学 191
第18章 用液相色谱结合高分辨率质谱进行金黄色葡萄球菌抗生素敏感性的代谢组学研究 202
第19章 在线胰蛋白酶分解耦合LC-MS/MS分析定量蛋白质的具体步骤 214
第20章 蛋白酶：功能蛋白质组学的关键支点 227
第21章 组合肽配体库在食物过敏组学中的应用 287
第22章 谷蛋白的高效提取和分解 295
第23章 基于磁珠的免疫分析血浆中肿瘤标志物的糖基化谱 301
第24章 无脊椎动物糖蛋白的蛋白质特异性分析 307
第25章 蛋白质组学研究在鉴定兼职蛋白中的应用 318
第26章 二维生化纯化方法在全面分析大分子蛋白质复合物中的应用 323
第27章 独立于数据的定量获取蛋白质组学数据分析方法 331
索引
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| 內容試閱：
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译者的话
功能蛋白质组学主要研究细胞或组织内与某个功能相关或在某种条件下表达的所有相关蛋白质，其核心是以蛋白质为中心，研究与之相关的各种生命过程，这是一个新兴的快速发展的科学研究领域，对于研究生命的基础功能特别是蛋白质功能有独特的视角，这一新的学科同时在药物开发和疾病诊断方面体现出越来越大的价值和潜力。
《功能蛋白质组学：技术与方法》一书翻译自王星博士和M. 库鲁茨博士编的Functional Proteomics: Methods and Protocols。本书的英文版自2018年在世界著名的Springer公司出版后迅速成为畅销的科学著作之一。基于此书的前沿性和在生命科学基础及应用方面的价值，译者决定将此书译成中文介绍到国内的生命科学领域。獐子岛集团股份有限公司对本书的出版提供了部分经费支持，在此表示感谢。本书是目前在功能蛋白质组学领域最系统和先进的理论与应用的集合，里面的综述文章 出自国际知名院校的科学家之手，体现了现在生命科学领域对系统生物学特别是功能蛋白质组学的理解和前瞻。本书收集了为研究蛋白质组规模的蛋白质功能开发的一系列方法和技术。书中的方法部分技术描述非常详细，基本概括了现在功能蛋白质组学最新进展。
希望读者通过本书，了解在功能蛋白质组学研究中的前沿技术，开阔基础研究思路，利用这些新技术开辟生物系统的蛋白质组功能研究新领域，提升功能蛋白质组学研究的应用。
前言
在过去的二十年里，蛋白质组学领域取得了巨大的进展，蛋白质组学研究的目的是发现蛋白质组的系统差异。可测量的蛋白质标志物一旦建立，则有助于阐明生物学机制、明确疾病机理、确定治疗靶点，以及提供更精确的个性化医疗干预措施。
与其他“组学”分析一样，蛋白质组学是数据驱动的，可以为各种结果分析提供比较客观的蛋白质组图谱。这些分析结果能形成系统水平的对比，例如，用药与非用药细胞模型对比、健康组织与病变组织对比等等。这个领域的发展使我们对许多生物系统和疾病有了更深入的了解。蛋白质组学领域的这些进展得益于许多分析技术尤其是质谱技术的发展，质谱技术已经从一种灵敏度较低的定性工具发展到用于蛋白质分析和表征的高灵敏度定量系统。目前，系统生物学特别是蛋白质组学正从两个不同但同样重要的方向推进生物学的发展：一个方向是对生物系统的整体理解，无论是有机体、器官、组织还是人体循环系统，另一个方向是对单细胞的分析，这样可以最大限度地减少生物的异质性，并可以在更同质的背景中对生物过程建立更严谨的模型。掌握从事这些重要研究必要的工具和方法，将极大地促进精准医学和其他生物领域的发展。
在蛋白质组学最常见的研究工作中，通常对总蛋白质组进行蛋白酶水解处理后获得数据，然后衍生肽通过纳升液相色谱-质谱联用仪（LC-MS）进行分析。这样由仪器产生肽的质谱，并通过进一步的碎裂化得到MS2谱，再与公共基因库中已知的氨基酸质谱进行比较。肽序列匹配是通过计算得到的，并且从这些数据鉴定出蛋白质。从这些分析中，来源于基因产物的肽标记物可以作为基因产物的替代物。通过对这些肽标记物的差异表达分析，蛋白质组学可以用来鉴定那些定义表型的基因产物。然而，作为几乎所有生物行为驱动力的蛋白质组的功能，并没有通过现有的LC-MS序列注释方法得到充分的阐明，这本书的目的是填补这一知识和技术的空白。本书汇集了蛋白质组规模的蛋白质功能研究所需的一系列技术。在组织编写这本书的内容时，我们考虑了以下几点：①应该将生物学的理解从蛋白质功能过渡到蛋白质分析的其他方面，特别是在蛋白质翻译后修饰方面，因为大多数细胞蛋白质利用这一机制来实现其在细胞调节中的独特作用。②本书还应该为系统生物学研究的其他领域提供桥梁，包括基因组学和代谢组学，以便读者能够对如何研究他们感兴趣的生物学系统有个完整的了解。③根据蛋白质功能分析的不同方面对分析技术进行了分类，以便读者可以在其特定的功能蛋白质组学研究中使用相应的技术。④最后，也介绍了对多种疾病当前和未来研究有重要影响的技术方法。
我们希望读者可以利用这些新技术，开辟生物学研究的新领域，确定重要的药物靶点，开发临床有效的生物标志物和诊断方法。本书编写旨在对我们在功能蛋白质组学研究中的新技术作一个最精确的描述和概括，并为读者提供他们在研究各种生物学系统的蛋白质组功能时所需的一系列方法。
王星，于美国密苏里州圣路易斯
M.库鲁茨，于美国新泽西州蒙茅斯
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