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內容簡介: |
噬菌体是细菌的病毒,在抗细菌感染方面有广阔的应用前景,尤其是在细菌耐药性对人类构成严峻挑战的大背景下,对噬菌体的研究与应用成为近年来人们高度关注的领域。《噬菌体学:从理论到实践》是一部系统介绍噬菌体基础理论、应用进展及经典操作技术的专著,共分为3篇40章:篇为基础理论篇,主要介绍噬菌体的形态结构、复制与生活周期、生理学特征等内容;第二篇为实践应用篇,主要介绍噬菌体在各领域的应用进展与前景;第三篇为操作技术篇,旨在为读者提供可行的实验操作方案。
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目錄:
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目录篇 基础理论篇 1 噬菌体的研究史及展望 02节 噬菌体的发现 02第二节 噬菌体研究对生命科学的历史贡献 05第三节 噬菌体的应用与展望 082 噬菌体的形态结构与繁殖 15节 宿主细菌结构和生理 15第二节 噬菌体的形态与结构 17第三节 噬菌体的繁殖 21第四节 溶原与假溶原 473 噬菌体的分类与命名 51节 病毒分类和命名的一般规则 51第二节 ICTV发布的噬菌体分类和命名 52第三节 新分离噬菌体的命名和分类 534 噬菌体相关的数学问题 55节 噬菌体计数 56第二节 噬菌体与细菌比 57第三节 噬菌体吸附 60第四节 噬菌体群体生长 625 噬菌体复制的基因调控 65节 噬菌体吸附宿主菌的分子基础与调控 66第二节 噬菌体基因组进入宿主菌的策略 68第三节 噬菌体裂解溶原的调控机制 70第四节 噬菌体溶原状态的维持与前噬菌体诱导 74第五节 噬菌体基因组的复制与调控 76第六节 基于转录终止与抗终止的噬菌体基因调控 78第七节 子代噬菌体的组装、成熟与释放调控 78第八节 噬菌体裂解宿主菌的机制 79第九节 细菌和噬菌体之间的交互调控 816 噬菌体调控宿主代谢的机制 84节 噬菌体编码蛋白抑制细菌分裂 84第二节 噬菌体编码蛋白抑制细菌DNA复制 87第三节 噬菌体编码蛋白抑制细菌转录 91第四节 噬菌体编码蛋白影响RNA降解 95第五节 噬菌体影响宿主的翻译过程 97第六节 噬菌体基因编码抑制细菌CRISPR-Cas系统 98第七节 噬菌体编码蛋白影响细菌代谢 1007 噬菌体生态学 103节 自然界中噬菌体的生态分布 103第二节 裂解性噬菌体的生态功能 108第三节 溶原性噬菌体的生态功能 112第四节 环境因子对噬菌体与宿主相互作用的影响及其机制 1148 人体噬菌体组 119节 人体噬菌体组的研究方法与挑战 119第二节 人体噬菌体组结构特征 123第三节 人体中噬菌体组与细菌组及与人体的相互作用 126第四节 特定疾病状态下噬菌体组组成特征 1279 噬菌体进化生物学 131节 进化的内因与外因 132第二节 噬菌体的进化 133第三节 噬菌体细菌共进化 13810 噬菌体与细菌致病性 144节 噬菌体编码细菌外毒素 144第二节 噬菌体编码其他细菌毒力相关蛋白 150第三节 噬菌体介导细菌抗生素抗性基因转移 154第四节 噬菌体影响细菌致病性 15511 噬菌体与哺乳动物的相互作用 163节 噬菌体在哺乳动物机体中的分布 163第二节 治疗用噬菌体在哺乳动物体内的过程 167第三节 噬菌体引发的机体固有免疫应答 170第四节 噬菌体引发机体产生的适应性免疫应答 173第五节 基于药代动力学的噬菌体工程化改造 17512 细菌对噬菌体的免疫机制 177节 抑制噬菌体吸附 178第二节 阻断噬菌体核酸注入 180第三节 降解噬菌体核酸 181第四节 介导噬菌体的流产感染 187第二篇 实践应用篇 13 CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用 196节 CRISPR-Cas系统的背景介绍 196第二节 抗CRISPR蛋白及其作用机制 199第三节 CRISPR-Cas9系统在基因组编辑中的应用 201第四节 CRISPR-Cas系统在病原微生物检测中的应用 20514 噬菌体与合成生物学 207节 噬菌体对合成生物学的贡献 207第二节 人工噬菌体合成与改造技术 209第三节 人工合成噬菌体的应用 21215 噬菌体治疗在人类疾病中的应用 216节 噬菌体治疗的历史 216第二节 噬菌体治疗的现状 221第三节 噬菌体临床应用的产业化发展 228第四节 噬菌体临床应用的瓶颈和方向 23016 噬菌体基因编码产物的抗细菌感染作用 235节 噬菌体裂解细菌的分子基础——裂解系统 235第二节 噬菌体裂解酶 236第三节 与裂解相关的其他噬菌体编码蛋白 249第四节 噬菌体解聚酶 252第五节 尾突蛋白 25517 噬菌体在生物检测中的应用 257节 利用基因工程噬菌体直接或间接显现荧光信号 257第二节 利用噬菌体形成肉眼可见的单克隆噬斑 260第三节 利用与噬菌体组装的材料间接呈现样品信号 262第四节 扩增噬菌体基因组的特异条带 264第五节 细菌的噬菌体分型 26618 噬菌体在食品安全中的应用 268节 食品安全中的重要威胁 269第二节 噬菌体在食源性病原菌中的应用 271第三节 噬菌体在不同食品中的应用 274第四节 食品行业商品化噬菌体制剂研发现状 278第五节 噬菌体在食品生物防控中的隐患及建议 28019 噬菌体在畜禽细菌感染防治中的应用 283节 噬菌体防治动物细菌感染的早期研究 283第二节 噬菌体防治动物感染的近期研究 284第三节 动物养殖领域限抗与噬菌体应用前景 29220 噬菌体在水产养殖中的应用 296节 水体中的噬菌体 296第二节 水产养殖中的细菌性疾病防控现状 297第三节 噬菌体在水产养殖中的应用 300第四节 噬菌体在水产养殖业的应用途径及现状 31021 噬菌体在土壤环境修复中的应用 313节 用噬菌体疗法灭活土壤环境系统中的致病菌 313第二节 噬菌体技术修复重金属污染 317第三节 噬菌体对土壤生态环境系统的影响 31922 噬菌体在疾病防控中的应用 323节 院内感染的严重性亟待解决 323第二节 噬菌体生存的环境条件 325第三节 应用噬菌体杀菌的必要条件 327第四节 噬菌体在疾病防控上的应用 330第五节 气雾式噬菌体环境清洁剂的实战经验 33423 噬菌体与发酵工业 338节 噬菌体对工业化发酵的危害 338第二节 控制噬菌体污染的方法与策略 345第三节 用噬菌体控制发酵罐中的细菌污染 35724 噬菌体载体及其应用 364节 基于丝状噬菌体的载体 364第二节 噬菌粒载体 367第三节 λ噬菌体载体 370第四节 噬菌体P1克隆系统 373第五节 噬菌体表达载体 377第六节 噬菌体作为分子治疗载体 37825 噬菌体展示技术及其应用 380节 噬菌体展示技术原理及特点 380第二节 噬菌体展示技术的应用 390第三篇 操作技术篇 26 噬菌体分离和纯化 398节 从天然环境中分离纯化噬菌体 398第二节 噬菌体储备液的制备、纯化和贮存 405第三节 噬菌体的保存 409第四节 特定噬菌体的分离案例 41027 噬菌体生物学性质测定 425节 噬菌体计数 425第二节 噬菌体宿主谱的测定 434第三节 噬菌体成斑效率的测定 435第四节 噬菌体吸附性质测定 437第五节 噬菌体一步生长曲线的测定 44128 噬菌体电子显微镜技术 446节 电子显微镜在噬菌体研究中的应用 446第二节 噬菌体形态学的透射电子显微镜技术 447第三节 观察噬菌体感染周期的超薄切片技术 45129 噬菌体冷冻电子显微镜技术 455节 冷冻电镜技术原理及发展 455第二节 冷冻电镜三维重构方法 460第三节 冷冻电镜在噬菌体研究中的应用及实例 46630 噬菌体基因组测序与分析 472节 噬菌体基因组提取及纯化 472第二节 噬菌体基因组测定 476第三节 基因组文库构建及测序 478第四节 测序数据分析 48331 从噬菌体单噬斑扩增噬菌体基因组与测序 486节 噬菌体分离纯化 487第二节 噬菌体全基因组扩增 489第三节 噬菌体全基因组测序 49932 噬菌体基因组序列的注释 504节 全基因组BLAST比对 504第二节 基因组末端鉴定 505第三节 基因鉴定 510第四节 系统发育树的构建 515第五节 结构域鉴定 52533 噬菌体基因组的数据挖掘及可视化 527节 从宏基因组数据中识别噬菌体序列 528第二节 噬菌体的比较基因组分析 547第三节 噬菌体基因组数据的可视化 56134 噬菌体基因组核酸碱基修饰的鉴定 572节 初步判断噬菌体基因组是否含修饰碱基 573第二节 噬菌体修饰碱基的分离分析技术 576第三节 应用第三代测序技术检测噬菌体修饰碱基 58035 噬菌体/宿主相互作用研究技术 587节 噬菌体受体结合蛋白的鉴定 587第二节 噬菌体展示研究蛋白质-蛋白质相互作用 590第三节 噬菌体的转导能力测试 594第四节 细菌转座子文库的构建与应用 59636 噬菌体与宿主菌的转录组学分析 600节 概述 600第二节 噬菌体与宿主菌转录组分析的样本制备 602第三节 噬菌体细菌相互作用的基因组芯片转录组分析 604第四节 噬菌体细菌相互作用的RNA-seq转录组分析 60537 噬菌体遗传改造技术 616节 裂解性噬菌体遗传操作技术 617第二节 溶原性噬菌体遗传操作技术 62538 噬菌体结构蛋白研究方法 627节 噬菌体结构蛋白的SDS-PAGE分析 627第二节 噬菌体结构蛋白的质谱分析 63439 噬菌体治疗制剂制备方法 640节 噬菌体治疗制剂制备的共性原则——GMP生产要素 640第二节 噬菌体制剂中内毒素的去除和检测方法 645第三节 微囊化噬菌体制剂的制备方法 647第四节 注意事项 65340 噬菌体注册监管法规要求与产品安全生产 654节 国际噬菌体产品的市场准入规定 654第二节 噬菌体产品的质量安全及相关工艺 667
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