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內容簡介: |
《紫胶虫的遗传与进化》系统地介绍了紫胶虫遗传与进化问题。采用数值分类方法对紫胶虫典型特征进行了支序分析,揭示其形态特征演化方向;运用核型分类标准对紫胶虫不同种类进行核型分析,并分析了紫胶虫染色体核型与产胶质量的关系;联合多基因信息构建分子系统树,得出了可靠的紫胶虫各种间系统发育关系,推断出印度板块是紫胶虫起源中心,其随印度板块漂移迁移扩散到亚欧大陆;分析了全球气候变化对紫胶虫进化与迁移具有重要影响,说明紫胶虫有着从热带气候区向亚热带气候区、干旱气候区向湿润气候区迁移扩散的趋势;筛选出紫胶合成关键基因并阐明其表达规律,初步揭示了紫胶虫体内合成紫胶的分子机制。
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目錄:
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目录第1章概述11.1紫胶与紫胶虫11.2紫胶虫的生活史21.3紫胶的理化性质21.4紫胶虫的泌胶特性31.5紫胶的经济价值41.6紫胶的生态价值6参考文献7第2章紫胶虫的形态特征和支序进化82.1紫胶虫的形态分类特征92.1.1分类特征的确定92.1.2形态特征的观察与测量102.1.3所选特征性状的极性确定112.1.4外类群的选择112.2紫胶虫形态特征图与显微测量122.2.1紫胶蚧Kerria lacca(Kerr)122.2.2普萨紫胶虫Kerria pusana(Misra)122.2.3尼泊尔紫胶虫Kerria nepalensis Varshney142.2.4田紫胶虫Kerria ruralis Wang152.2.5信德紫胶虫Kerria sindica(Mahdihassan)162.2.6中华紫胶虫Kerria chinensis(Mahdihassan)172.2.7云南紫胶虫Kerria yunnanensis Ou et Hong182.3紫胶虫支序进化分析192.3.1紫胶虫的形态特征测量192.3.2极性赋值202.3.3数据矩阵212.3.4紫胶虫的支序进化分析212.3.5紫胶虫形态特征与生态适应性23参考文献25第3章紫胶虫的染色体核型进化分析263.1紫胶虫染色体的二倍体数目273.2染色体大小283.3紫胶虫主要种类核型比较293.3.1中华紫胶虫Kerria chinensis(Mahdihassan)303.3.2云南紫胶虫Kerria yunnanensis Ou et Hong313.3.3紫胶蚧Kerria lacca(Kerr)323.3.4田紫胶虫Kerria ruralis Wang333.3.5普萨紫胶虫Kerria pusana(Misra)353.3.6尼泊尔紫胶虫Kerria nepalensis Varshney363.3.7信德紫胶虫Kerria sindica(Mahdihassan)373.4田紫胶虫红、黄两种色型的染色体比较383.4.1染色体形状与数量383.4.2核型分析对比393.5种间核型比较与亲缘关系423.6紫胶虫的核型似近系数聚类分析结果443.7核型进化473.8核型与产胶质量的关系48参考文献49第4章紫胶虫全基因组扫描514.1DNA建库524.2测序深度534.3测序质量评估534.4K-mer分析554.5基因组组装564.6GC含量分布574.7结论58参考文献58第5章紫胶虫分子进化分析605.1基因测序635.2序列碱基组成和特征645.3基于核糖体28SrRNA数据的系统发育分析675.4基于核基因EF1α数据的系统发育分析685.5基于合并数据的系统发育分析705.6亲缘关系分析71参考文献74第6章紫胶虫生物地理学分析766.1不同地理种群DNA保存与多基因测序766.2序列特征786.3基于多基因序列独立及联合构建系统树786.3.1基于EF1α基因系统发育关系分析796.3.2基于28SrRNA基因系统发育关系分析806.3.3多基因联合序列系统树建立816.4中国特有种分类地位确定846.5生物地理学分析84参考文献89第7章紫胶合成通路关键基因及其表达规律分析917.1个体泌胶速率917.2转录组学分析策略927.3高通量测序和组装937.4转录组注释947.5GO、KEGG、KOG注释结果957.6差异基因表达分析987.6.1蛋白质代谢997.6.2物质代谢途径1017.6.3非中枢代谢途径1027.6.4参与泌胶的候选基因1027.7差异表达基因的荧光定量PCR验证104参考文献107
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