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內容簡介: |
生物信息学是生命科学研究的重大前沿领域之一。本书首先概述了生物信息学的基本概念、发展历史与存在的问题。第一部分介绍了生物信息学的基础知识,包括生物信息学数据库、比对工具和结构预测。第二部分介绍了基因组学、蛋白质组学和转录组学分析策略,第三部分系统生物学和分子进化分析,最后阐述了生物信息学的研究开发平台,如生物统计和生物信息学编程工具。每个章节之后,都附有权威参考文献和思考题。
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目錄:
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序
第二版前言
第一版前言
第一章 生物信息学的概念及其发展历史
第一节生物信息学的发展历史
第二节生物信息学的研究领域
第三节生物信息学的主要应用
第四节 生物信息学面临的挑战
思考题
参考文献
第二章 生物学数据库及其检索
第一节生物学数据库简介
第二节生物学数据库的内容与结构
第三节生物学数据库的检索
思考题
参考文献
第三章序列比对原理
第一节序列比对相关概念
第二节序列比对打分方法
第三节序列比对算法
第四节序列比对工具
第五节多序列比对
思考题
参考文献
第四章 蛋白质结构预测与分析
第一节蛋白质结构组织层次
第二节蛋白质结构的测定与理论预测
第三节蛋白质对接
第四节蛋白质折叠与疾病
思考题
参考文献
第五章 真核生物基因组的注释
第一节 蛋白质编码基因的注释
第二节RNA基因的注释
第三节重复序列的注释
第四节假基因的注释
第五节 案例分析:黄瓜基因组的注释
思考题
参考文献
第六章蛋白质组学
第一节蛋白质组学概述
第二节 蛋白质的大规模分离鉴定技术
第三节蛋白质的翻译后修饰
第四节蛋白质分选
第五节蛋白质相互作用
思考题
参考文献
第七章系统生物学
第一节 系统生物学基本概念
第二节 系统生物学基本技术与方法
第三节先进的成像技术
第四节基因表达调控网络
第五节代谢网络
第六节信号转导途径
第七节 蛋白质一蛋白质相互作用网络
第八节虚拟细胞
思考题
参考文献
第八章合成生物学
第一节合成生物学概述
第二节合成生物学基础研究经典实例
第三节 合成生物学应用研究经典实例
思考题
参考文献
第九章分子进化与系统发育
第一节分子进化与系统发育
第二节 分子系统发育树的构建方法
第三节系统发育树构建及应用
思考题
参考文献
第十章统计学习与推理
第一节统计学习与推理基础
第二节统计模型与参数推断
第三节 聚类分析、主成分分析与Fisher判别
第四节 贝叶斯推理
第五节隐马尔可夫模型
第六节动态神经网络
第七节支持向量机
第八节MATLAB的应用实例
思考题
参考文献
第十一章 生物信息学编程基础
第一节Linux操作系统
第二节 生物信息学中的编程语言
第三节SQL及数据库编程
第四节并行计算
思考题
参考文献
第十二章第二代测序技术及其应用
第一节测序技术概述
第二节第二代测序原理
第三节第二代测序技术的应用
第四节 生物信息学在第二代测序中的应用
思考题
参考文献
彩版
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